请问,GenBank里面的序列都是gene吗?如果是,为什么我找的序列里面没有关于gene的描述呢?貌似只有一个sts的标注。
有点相关的问题
- 向genbank提交序列的问题 (1.000)
- 有没有什么快速解析genbank格式的代码(perl或python) (1.000)
- 本地数据库如何更新 (1.000)
- 怎么把Genbank格式的数据里面的特定的几行数据提取出来 (1.000)
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未解决
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请问,GenBank里面的序列都是gene吗?如果是,为什么我找的序列里面没有关于gene的描述呢?貌似只有一个sts的标注。 有点相关的问题
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肯定不是了。genbank里什么序列都有。不一定都是基因的。是基因的话都有CDS区或是protein信息的了。~~
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@O型天蝎座:
有没有这种情况:
在gene database里面有信息,但是在对应的protein database里面没有信息?
我找基因名字的时候在蛋白库里弄的,不知道有没有漏网的,会不会在蛋白库里面没有同源序列而在基因库里面有基因的同源序列呢?
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@rebeccajiejie:是的啊。好多gene database里面的gene序列都是不完整的。或是ATG还不明之类的。 核酸序列肯定远远多于蛋白序列了。
按蛋白序列就比较精确吧。冗余较少。。。。
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@O型天蝎座:
哎呀,我悲剧了。找了一堆东西,一直很自信地认为是EST,可是到EST数据库里面找不到相关的资料。不过幸好合成之前检查了一下,不然真的初大问题了。呵呵~~
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