我利用本地blast，将大量文库序列（实验室测序）与数据库比对，得到了比对结果，其中有大量SNP，请问如何统计不同类型SNP（转换、巅换等）数量。有没有相关软件？谢谢！
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未解决
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我利用本地blast，将大量文库序列（实验室测序）与数据库比对，得到了比对结果，其中有大量SNP，请问如何统计不同类型SNP（转换、巅换等）数量。有没有相关软件？谢谢！ 有点相关的问题
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多条序列同时比对在本地化blast里面的program选什么呢？
phrap软件貌似可以做snp的寻找，结果好像有统计的
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用emboss的diffseq程序也是可以查找SNP的
diffseq： Find differences (SNPs) between nearly identical sequences
http://evol.biology.mcmaster.ca/EMBOSS-Pise.html
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请问你有没有找过特异性基因？
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