我们有上百万条不同长度的contigs,其中一些有重叠区,想把这些有重叠的序列拼接成更长的contigs。但我们的计算机配置不高,内存12G, CPU志强5620。请问除了耗内存的软件外,还有没有合适的软件啊?
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未解决
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我们有上百万条不同长度的contigs,其中一些有重叠区,想把这些有重叠的序列拼接成更长的contigs。但我们的计算机配置不高,内存12G, CPU志强5620。请问除了耗内存的软件外,还有没有合适的软件啊? |
不知道 seqman 和ContigExpress是不适合你 或者可以自己算法编程
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phrap ?
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需要补充说明一下,contigs不是直接测序仪出来的,是由short reads拼接而得的。
9●