scan_for_matches Scan Nucleotide or Protein Sequences for Matching Patterns
不知有没理解错，这软件应该是通过正则来匹配核酸或蛋白序列的。
linux下的软件下载：
http://code.google.com/p/biopieces/downloads/detail?name=scan_for_matches.tar.gz&can=2&q=
bioperl里的模块：
http://search.cpan.org/dist/bioperl-run/Bio/Tools/Run/PiseApplication/scan_for_matches.pm
在线的scan for matches
http://mobyle.pasteur.fr/cgi-bin/portal.py?form=scan_for_matches
返回的该Patterns在序列中的位置。
