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未解决

柳同学,讲下kegg的用法吧




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    具体点~ 你给个例子。

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    >T01
    TTTTTTTTGCAATTATGGGACGCATATTAGTTGAAGTGACGATTCATGCATGTTTGGTCAAAATTTTCAGTGAATAGTCTCCGTATTTATGACTCTAAATTAATTTATTATGAAAACAGAATTAGTTTTTTAGTTAATCTAATAGTATGCTATTCTATA
    >T02
    GGCAACCATGGTCCATGGCCGGCGCAGAGCCGCCGCCTGATCTTATCGCCCGCGCACAAATTACCACATGCGCGGCGCGCACCGGATCCGACGTCACGTCGACCTCATCTCCAAGCCTCTTCCAAACACTCCAATGCGTACTGGATGACTGGGTGCTGTGCCGGATCTACAACAAGAAGGGTGTTATCGAGCGGTACGACACAGTGGACGACGACGACGGCGACGGCGCCGTGGCCGAAGACGTCAAGCCGGTGCCGGCGCCGGCGGCGTCGAAGAACCCGCGTGCCAGTGCCCGCGTAGGGGCAGCAGCGGCGGCGCCGATGAAGGTGGAGCTCCCCGAGTACGGCGGCGGCTACTACGACTACGACGACCTGGAGACGCCGTCGGCGGGGATGCTGTGCTTCGACCGCCCGTCGGCCCCGGCGCCCGCGGACCGCGACTCAAACAACTCCGTGCCGTGGACGACGCACCACACGCACACGGACAACTCCAGCAGCGGCTCCGAGCGCGTGCTCTCGCCGTCGCCGGACCTGCCCGACCGCGACCACGCCGAGAGCCAGCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGGTGGTGGCCTGTCGGAGGCGACTGGGGCAGCGCCGCCGAGGACGGGTTCATGGTCGACGTCGACGTCGACGACGGGAGCTCGCTGTTCGGGCCGCTGTCCCCGGGGCTGTTCGCGCGCGTCGACGCCGCCGCGTTCGGCTTCGGCGACATGCTCGCGTCGTACCTGCACAAACCGTTCTGATGCAACGCGACGCGACGCGAGCGCGGCCACCCCGCGCCTGCGTGCTCCTCTAGGCCACTGACCACTGACATGGACATTCTGGTCGTCGTGTAGCTCGGTTCAGGACGAATCGAGAGCCGGCCGGTCTAGGTGTAGTGCTGCGAAACCAACACCACCGTGCAGGCACACTCTCCGCGGGCGGCAGATCGACGGACAATCCTGCGCCCGTAGGTATATACCGGTCGTCGATCAGGTGTTCATCAGTTCTTCATTCATTCAGGTCGACGTGCAACTGGTAATTGTACAAGATCTTGGGCAGCTGCCGTATGGAGATCGATGAGTGCCGAGTTAGCATGGAGGACGACTGGTGGTCATGGTTGGTACAGAGCTAGCTAGCCGTCCGATCGGGTATCGGATTAATCTGATTGCCAGTTTTGTTTTTTTTTGGTCGCGTCAAGTAGCTGACATCTTAAGAATGAAGCCTACTGGATTCAGAGGCCTGTTGATGGTAATGGTATGGTGTATGTATATCGTCTAGTTTAGTCTAGCCTAGCTGTACTTAGAATTGGTTCAGGTTGGTGGCAAGCAGAGCGCTGTAATTTTTGTTGAGTGTTTATGCACTATAATTGCAACGTCATGTATTAGAGTCGCTCTCAGCGGTCGCTTTCTCGTGATCGAAAATTTTGCGATGCAAATTATCCTAATAAAGTTGTTGTAAGATGTAATTACG
    >T03
    GTTACGTAGTAGTAGTACTTAACAACAACACGTGGCGCCGCCGTGGCGCTGATAGATGCGGCCATGGACAGTAACGGCGAGTGCTCGTCGCCCCCCACCCTCAGCGCCGCGCTTCTGCCCCTCTTCGGCCCACCGCCGGAGCCGCTGCCGGAGAGTCTCGAGGACAAGCTGAGGCGGGTGAGCGAGGAGAACCGGAGGCTGGCCGCCGCGCTGGACGCCATACTCGCCGACCGCTCCACCCCGCGAGCGCTCGCCACGTCGTCGCCGTCCCGGGGCAATGCGGTGGCCGCCGCGGAGCCGCCGCGGCCCAAGGTCCGGACGGTGTGCGCGCGCGCCGAGCCGTCGGACGCCGACGCCAACCACCTCAGGGACTGCTACCAGTGGCGCAAGTACGGCCAGAAGGTGACGCGGGACAACCCGTATCCGAGATCCTACTTCCGCTGCGCGTACGCGCCCTCCTGCCCCGTCAAGAAGAAGGTGCAGAGAAGCGCAGACGACAATCTGATGCTTGTGGCGACGTACGAGGGCGAGCACAACCATGAGCAACGTGCCCAGAGCGAATATGTCGTCACTGACGCGTCGACGAGCCTGCACCAGGCCGGGTCGTCACTGCCGCGCTCGATCATCTCCATCGATTCGTCGGGCCGGAAAAAGATCACCATTGGCCTGGCCGCGGACCAACGGCCGCCGGCGGATTCGAATGCCGGGGCGGCCGTCGGGGAGATTATTGTGACGCCTGAGTTTCGGAAGGCTCTGGTGGACGAGCTCGTGAATTTGCTCACGAATGATTCCGAGTTCGTCGAGAAGCTGGCGAGCGCCGTGGCTGATAGGGTGATGGAGAGAATACCAGGGCACATATTCTGATGCATGGCGCTCGTGGATGCAAAATAAATGTGAATATACACATGTTTTTTTTTGCGGTTGAAGAACATTAATATGTCTATGTAATAAACTTAGGTCTTGTCTATTTTCATAGTGCTAAAGTTTAGCACAACATTTTTTTTACTAAA
    

    对这3条序列做go分析以及代谢途径分析

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    go分析嘛,我猜可以用Blast2GO。我没用过

    下载:http://www.blast2go.org/downloads
    或是GO上也有blast: http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/blast.cgi

    KEGG分析,可用KEGG提供的Blast

    http://blast.genome.jp/

    http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html (这个页面可找到KEGG的大部分工具。)

    序列丢进去,选择需要的数据库,就出来结果了。

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