柳同学,讲下kegg的用法吧
具体点~ 你给个例子。
>T01 TTTTTTTTGCAATTATGGGACGCATATTAGTTGAAGTGACGATTCATGCATGTTTGGTCAAAATTTTCAGTGAATAGTCTCCGTATTTATGACTCTAAATTAATTTATTATGAAAACAGAATTAGTTTTTTAGTTAATCTAATAGTATGCTATTCTATA >T02 GGCAACCATGGTCCATGGCCGGCGCAGAGCCGCCGCCTGATCTTATCGCCCGCGCACAAATTACCACATGCGCGGCGCGCACCGGATCCGACGTCACGTCGACCTCATCTCCAAGCCTCTTCCAAACACTCCAATGCGTACTGGATGACTGGGTGCTGTGCCGGATCTACAACAAGAAGGGTGTTATCGAGCGGTACGACACAGTGGACGACGACGACGGCGACGGCGCCGTGGCCGAAGACGTCAAGCCGGTGCCGGCGCCGGCGGCGTCGAAGAACCCGCGTGCCAGTGCCCGCGTAGGGGCAGCAGCGGCGGCGCCGATGAAGGTGGAGCTCCCCGAGTACGGCGGCGGCTACTACGACTACGACGACCTGGAGACGCCGTCGGCGGGGATGCTGTGCTTCGACCGCCCGTCGGCCCCGGCGCCCGCGGACCGCGACTCAAACAACTCCGTGCCGTGGACGACGCACCACACGCACACGGACAACTCCAGCAGCGGCTCCGAGCGCGTGCTCTCGCCGTCGCCGGACCTGCCCGACCGCGACCACGCCGAGAGCCAGCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGGTGGTGGCCTGTCGGAGGCGACTGGGGCAGCGCCGCCGAGGACGGGTTCATGGTCGACGTCGACGTCGACGACGGGAGCTCGCTGTTCGGGCCGCTGTCCCCGGGGCTGTTCGCGCGCGTCGACGCCGCCGCGTTCGGCTTCGGCGACATGCTCGCGTCGTACCTGCACAAACCGTTCTGATGCAACGCGACGCGACGCGAGCGCGGCCACCCCGCGCCTGCGTGCTCCTCTAGGCCACTGACCACTGACATGGACATTCTGGTCGTCGTGTAGCTCGGTTCAGGACGAATCGAGAGCCGGCCGGTCTAGGTGTAGTGCTGCGAAACCAACACCACCGTGCAGGCACACTCTCCGCGGGCGGCAGATCGACGGACAATCCTGCGCCCGTAGGTATATACCGGTCGTCGATCAGGTGTTCATCAGTTCTTCATTCATTCAGGTCGACGTGCAACTGGTAATTGTACAAGATCTTGGGCAGCTGCCGTATGGAGATCGATGAGTGCCGAGTTAGCATGGAGGACGACTGGTGGTCATGGTTGGTACAGAGCTAGCTAGCCGTCCGATCGGGTATCGGATTAATCTGATTGCCAGTTTTGTTTTTTTTTGGTCGCGTCAAGTAGCTGACATCTTAAGAATGAAGCCTACTGGATTCAGAGGCCTGTTGATGGTAATGGTATGGTGTATGTATATCGTCTAGTTTAGTCTAGCCTAGCTGTACTTAGAATTGGTTCAGGTTGGTGGCAAGCAGAGCGCTGTAATTTTTGTTGAGTGTTTATGCACTATAATTGCAACGTCATGTATTAGAGTCGCTCTCAGCGGTCGCTTTCTCGTGATCGAAAATTTTGCGATGCAAATTATCCTAATAAAGTTGTTGTAAGATGTAATTACG >T03 GTTACGTAGTAGTAGTACTTAACAACAACACGTGGCGCCGCCGTGGCGCTGATAGATGCGGCCATGGACAGTAACGGCGAGTGCTCGTCGCCCCCCACCCTCAGCGCCGCGCTTCTGCCCCTCTTCGGCCCACCGCCGGAGCCGCTGCCGGAGAGTCTCGAGGACAAGCTGAGGCGGGTGAGCGAGGAGAACCGGAGGCTGGCCGCCGCGCTGGACGCCATACTCGCCGACCGCTCCACCCCGCGAGCGCTCGCCACGTCGTCGCCGTCCCGGGGCAATGCGGTGGCCGCCGCGGAGCCGCCGCGGCCCAAGGTCCGGACGGTGTGCGCGCGCGCCGAGCCGTCGGACGCCGACGCCAACCACCTCAGGGACTGCTACCAGTGGCGCAAGTACGGCCAGAAGGTGACGCGGGACAACCCGTATCCGAGATCCTACTTCCGCTGCGCGTACGCGCCCTCCTGCCCCGTCAAGAAGAAGGTGCAGAGAAGCGCAGACGACAATCTGATGCTTGTGGCGACGTACGAGGGCGAGCACAACCATGAGCAACGTGCCCAGAGCGAATATGTCGTCACTGACGCGTCGACGAGCCTGCACCAGGCCGGGTCGTCACTGCCGCGCTCGATCATCTCCATCGATTCGTCGGGCCGGAAAAAGATCACCATTGGCCTGGCCGCGGACCAACGGCCGCCGGCGGATTCGAATGCCGGGGCGGCCGTCGGGGAGATTATTGTGACGCCTGAGTTTCGGAAGGCTCTGGTGGACGAGCTCGTGAATTTGCTCACGAATGATTCCGAGTTCGTCGAGAAGCTGGCGAGCGCCGTGGCTGATAGGGTGATGGAGAGAATACCAGGGCACATATTCTGATGCATGGCGCTCGTGGATGCAAAATAAATGTGAATATACACATGTTTTTTTTTGCGGTTGAAGAACATTAATATGTCTATGTAATAAACTTAGGTCTTGTCTATTTTCATAGTGCTAAAGTTTAGCACAACATTTTTTTTACTAAA
对这3条序列做go分析以及代谢途径分析
go分析嘛,我猜可以用Blast2GO。我没用过
下载:http://www.blast2go.org/downloads 或是GO上也有blast: http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/blast.cgi
KEGG分析,可用KEGG提供的Blast
http://blast.genome.jp/
http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html (这个页面可找到KEGG的大部分工具。)
序列丢进去,选择需要的数据库,就出来结果了。
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具体点~ 你给个例子。
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对这3条序列做go分析以及代谢途径分析
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go分析嘛,我猜可以用Blast2GO。我没用过
下载:http://www.blast2go.org/downloads
或是GO上也有blast: http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/blast.cgi
KEGG分析,可用KEGG提供的Blast
http://blast.genome.jp/
http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html (这个页面可找到KEGG的大部分工具。)
序列丢进去,选择需要的数据库,就出来结果了。
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