比如已经找出相关的SNP位点,然后想把这些SNP在染色体的位置画出来,有没有人知道怎么做? 谢谢!
agias
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这家伙很懒,什么也没留下。 |
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请大家帮我看看这个程序报错是因为什么?
写的代码老是在given-when报错,抄了个书上的代码测试了一下,也报错,请大家帮我看看什么原因? 1 #!/usr/bin/perl 2 use warnings; 3 4 given($ARGV[0]){ 5 [...]
九月 3rd, 2011 17:56 agias
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求助一个正则匹配的问题
现有一条fasta格式的序列,想提取以gb开头的部分出来,但是发现该字段内部有换行符,比如下面这个gb=AF2,后面的85449就跑到另一行去了。我现在只知道以每行为单位处理,不知道怎么处理这种跨行的。 我的目的是想把下面格式中的 >gnl|UG|Ssc#S6090334 Sus scrofa myeloid DAP12-associating lectin short form [...]...
八月 23rd, 2011 16:10 agias
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本地blast -b参数
博主您好,今天尝试着构建本地blast,试了一条序列,结果发现使用“-b1”参数后,显示的结果总是多余1,不太理解这个结果,请您帮忙看一下是我哪里弄错了? 比对名命令为 blastall -p blastn -i input -d database [...]
五月 15th, 2011 19:09 agias