我有一个3G的文件，是phylip protdist得到的output文件，里面是一个15490*15490的矩阵，但是它们都是0.000000这样格式的，我想只要小数点后４位，如何运算呢？ 数据格式如下：我知道perl里面有printf命令，但是我只会用split(/\s+/,$file)，我想是不是可以用awk这样的快速的方法，由于数据太大（3G），所以，请各位帮帮忙！谢谢了！ 15490 2GECDDH 0.000000 0.091953 0.282887 0.255746 0.591753 [...]...
bioxp
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这家伙很懒，什么也没留下。 |
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求助，NCBI里面有没有针对环境样品的批量blast？
我有一批环境样品，是细菌和真菌的，有1000多条，想知道是些什么物种的，一个一个对NCBI里面比对的话，太耗时，且结果不好整理，我下载了NCBI里面的nt数据库，想本地BLAST，但是不知是不是数据库太大了（约15G），一直都没有动静，机器是普通双核电脑，没有显示结果…… 请教各位高手，是否能在NCBI上批量blast环境样品？谢谢...
十二月 2nd, 2010 17:46 bioxp
