boboppie

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这家伙很懒,什么也没留下。
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2011年生物信息学回顾? (2011 Bioinformatics Yearly Review)

不知道有没有相关的review?
一月 9th, 2012 18:08

 
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第五届亚洲生物信息学网上讲座

  The 5th Virtual Training Workshop on Bioinformatics Asian Bioinformatics [...]
十一月 21st, 2011 22:53

 
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Hadoop在国内生信的发展状况?

有没有了解这方面的信息,这个系统在西方已经非常流行,不知道现在国内比较有钱的实验室/公司是不是已经上这套系统了? 谢谢
九月 21st, 2011 22:01

 
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袁隆平的超级稻有没有申请任何基因专利?

不是特别清楚基因专利的申请,就超级稻本身来讲,它是遗传杂交的后代,基因早已不是wild type了,还能申请专利吗? 那么超级稻已经申请过专利了吗? 好像记得袁老师说不申请专利? [Edit] 这里提到“植物品种”是不能申请专利的,那基因专利就是针对未知的基因而言吗? 超级稻只是受益于已知基因的变异? 谢谢...
九月 19th, 2011 17:19

 
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有谁了解RNA-Seq在国内的发展状态?

BGI应该有做这个,其他的研究所呢? 一般用于什么的研究? 是用ad-hoc的生物信息分析方法,还是用成熟的pipeline多些? Pipeline是用国外的,还是自己开发?   谢谢
九月 8th, 2011 18:06

 
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那里能找到最全的进化树

包括序列对比? 谢谢
八月 2nd, 2011 15:16

 
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BioPerl vs BioPython

Python现在大有颠覆Perl在生物界的趋势,我个人认为这是无可厚非的,其实perl和python我都用过,都不精,只是直观的感觉python的code易读,不过我也喜欢perl奇怪的符号 我没接触过一丁点BioPython, 不过对BioPerl我是有点爱不释手的感觉。想请问一下有木有哪位有BioPython的编程经验,这个project现在发展如何,能否超越BioPerl? 虽然这个问题仁者见仁,我的主要目的还是考察一下这些projects发展情况。...
七月 11th, 2011 22:40

 
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SNPs数据的使用问题

由于本人不是生物出身,有些问题可能比较基础,望指教 SNPs好像只被用于人类,其他生物的SNPs数据没有重大意义,这个说法对吗?为什么? 有没有其他生物的SNPs方面的研究呢? GWAS的结果是找出一些SNPs (或其他变异), 它们作为一个指标,有较大可能性推导出疾病的发生, 但是GWAS之后是什么呢? 如何验证这些结果? 是在cell line上做实验吗? [...]...
七月 1st, 2011 22:03

 
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目前常用的将genotypes(genes)和phenotypes相关联的研究方法?

谁能举例说明? 好像GWAS是一种,但是怎么关联的呢? Update: 感谢 @盛夏 同学的总结 请大家继续讨论其他的方法
六月 26th, 2011 0:54

 
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谁了解next generation sequencing的样本是如何准备的,来自于哪里?

Nature Review上有篇不错的文章,不过我希望搞实验的生物学家能给简单解释下? 样本是来自于一个个体,还是多个个体混合在一起的?
六月 21st, 2011 17:45

 
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为什么NGS的mapping软件(如BWA)考虑gap?

谁能较详细的讲解下?
六月 16th, 2011 19:17

 
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有关网站的推广,大家提点意见建议?

你认识的朋友同事有人在用这个网站提问回答问题吗? 你会把它告诉你的朋友同事吗? 你觉得网站有哪些不足, 如何改进?   个人感觉网站的界面稍微有点混乱.  不知能不能效仿知乎,请一些大牛来这里  
六月 10th, 2011 19:45

 
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谁能直白的解释一下deep sequencing里coverage的概念?

这个deep是指什么? coverage是指什么? 能举个例子吗?
六月 8th, 2011 21:10

 
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Social Connectivity

第一次提问, 虽然和生信没有直接的关系,不过一直是我关心的问题。 大家一般都使用什么社交工具呢,新浪微薄, 人人,开心,qq, twitter, facebook, linkedin , msn, gtalk, [...]
六月 2nd, 2011 20:31