从NCBI GEO上下载CEL或者CHP基因芯片数据文件,请教各位大侠如何将它们打开,并做一些分析,存储。谢谢各位大侠了
chenjin
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这家伙很懒,什么也没留下。 |
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请教个问题,我用基因芯片得到一批数据,但是它是EST编号,我要怎样才能批量获得Ensemble编号?
请教个问题,我用基因芯片得到一批数据,但是它是EST编号,我要怎样才能批量获得Ensemble编号?
三月 1st, 2012 22:13 chenjin
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关于基因芯片探针对应基因模型编号
各位大侠,最近在分析基因数据。小弟遇到一个问题,就是怎么把探针号和基因模型编码对应起来。 在公司提供的编码中对应有由ENSEMBL产生的编号,但是这个不是官方编号。我用的是 Affy的杨树芯片。 比如: Ptp.1010.1.A1_s_at对应的是POPTRDRAFT_639895,但是我需要的是有JGI产生的POPTR_0647s00220。...
二月 21st, 2012 15:46 chenjin
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ncbi中的基因序号和phytozome中的基因是如何对应的?
请问各位前辈:ncbi中的基因序号和phytozome中的基因是如何对应的?我在NCBI上找到杨树基因ID如何找到拟南芥对应的JGI gene accession?有没有关于JCI的教程?
十一月 29th, 2011 15:09 chenjin
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Gene Ontology 入门
各位,小弟看到文献有关于Gene Ontology,之前对这一方面根本就不了解,网上查了下也没有什么材料,可否请哪位高手指点下,弄个案例分析或者操作手册什么,能够详细分析Gene Ontology最好了,目前正在攻克英文主页,实在很吃力。
十月 12th, 2011 16:46 chenjin
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如何从克隆测序出来的cDNA序列找出对应Genomic DNA序列?
如何从克隆测序出来的cDNA序列找出对应Genomic DNA序列?请原谅我是个新手。小弟在此谢谢各位大侠。
五月 25th, 2011 22:14 chenjin
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