请问有谁用过ModelGenerator?我下载了软件,但就是找不到软件的使用说明书,在windows下操作,dos 窗口命令要求输入number of discrete gamma catogries,不知道输入的数字对模型的选择有何影响? 还有我要构多基因树,不知道多个基因连接起来是否可以用于model generator分析?...
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这家伙很懒,什么也没留下。 |
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求学习bioperl的最佳方式
本人生物信息学基础较差 想学习bioperl 求学习bioperl的最佳方式 有什么好书或好的网站 或好的论坛
五月 5th, 2012 10:34 fieldtowtree
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怎样查看所有已有蛋白质注释信息的物种
怎样查看Genbank所有已有蛋白质组注释信息的物种?怎样在Genbank获得特定物种的蛋白质组?
三月 27th, 2012 23:59 fieldtowtree
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求教ncbi nr数据库的fasta格式
求教ncbi ftpsite 中nr数据库fasta格式的第一行注释是什么意思 ?为什么有这么多gi号和不同的物种名 ? 有谁知道关于nr数据库fasta格式的解释的网页
三月 26th, 2012 17:12 fieldtowtree
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sequence view里复制序列
在特定物种基因组中Blast,获得登录号,点击登录号,然后点击graphics出现图形界面,点击sequence view,在sequence view里只能浏览序列,不能复制序列,请问有谁会不会在sequence view里复制序列啊
十月 9th, 2011 17:03 fieldtowtree
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特定基因组blast 数据库对结果有何影响
在genome mapviewer 中选定特定的物种,然后blast,在blast界面database一栏,有Genome(referrence only),RefSeqRNA,EST,tRACEs-WGS,选不同的数据库数据会有什么差别? 我用非编码序列query,选Genome能有结果,而选RefSeq则不能找到具有显著相似性的序列,这是为什么?...
十月 8th, 2011 17:07 fieldtowtree
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如何用生物信息学的方法查找目的基因在基因组中的情况
如何用生物信息学的方法 查找目的基因在基因组中的拷贝数、该目的基因是否串联重复、与其连接的基因是什么基因?急用 谢谢!
十月 8th, 2011 16:03 fieldtowtree
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求提取基因间隔区序列的方法
只知道特定基因在基因组中的位置,想提取基因间隔区序列,需要怎样才能把基因间隔区准确提取?而不是只提取一部分间隔区序列?需要到mapviewer上看基因在基因组中的位置吗?看其邻近的基因 一个一个提吗?
八月 25th, 2011 14:39 fieldtowtree
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求软件rRNA_extractor.pl
本人用tRNAscan-SE提取tRNA在基因组中的位置之后,需要rRNA_extractor.pl软件提取序列,这是在北京华大基因生物信息学培训教材里找的,PDF里只说在教材附带的软件包里,可PDF我只是在网上找的,估计是盗版的。谁有北京华大基因生物信息学培训教材附带的软件包阿?急用望分享 ...
八月 24th, 2011 14:50 fieldtowtree
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