测了几个转录组,需要做GO和kegg;但是都不是模式生物,没有本物种的GO数据库,像这种情况怎么去做,希望得到大家的指导。 貌似Interpro可以,那么我需要手动先把我的序列按六种ORF框翻译成蛋白序列么?还是提供个map得到的Gene ID即可?? 例外kegg现在ftp已经收费了,是不是对分析大通量转录组数据很不利?看之前的帖子提到API不受影响,但是我理解API的实现方式也是需要上传到服务器端的数据库进行比对;这种海量数据不现实。不知道我猜测的对不对…… [...]...
gaoyang636
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这家伙很懒,什么也没留下。 |