我用mega4构建的进化树好像有些问题。换了很多种model和方法得到的bootstrap值都有些特别小的值,有的分支甚至为0.按道理的话这样得到的树是不可信的。我看文献一般得到的树的bootstrap值都在90~100之间。我的问题究竟出在哪儿呢?该怎么改进?烦请赐教啊~ 我多重比对的序列大概有15条左右(也试过只建树其中的某几条序列),均属一个科的序列(主要为该科的三个不同的种),是用同一对引物扩增同一个编码区后获得的片段,长度均在300左右,彼此长度差异很小,多重比对和建树(NJ和ME MP 都试过)的参数为默认,bootstrap的replication值勾选的是1000和2000甚至5000都试过,不胜感激!...
ged
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这家伙很懒,什么也没留下。 |