最近在尝试用BWA进行重测序数据的分析，但是在比对过程中，得到的大多是二进制文件，无法弄清楚哪一列是什么数据，代表什么意思。之后用samtools进行call SNP和indel时，也说文件有问题，但不知道问题出在哪里。 希望有用过BWA进行比对的高人给予指导！小弟万分感谢！~~~...
motianfeng
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这家伙很懒，什么也没留下。 |
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求助：如何从众多数据中提取数据的坐标信息
各位大虾，现在我有一个好几G的关于23条染色体上每个碱基位点测序深度的数据，但是有些位点的测序深度太离谱，明显超出了正常的范围，有些地方甚至过万。所以，想通过perl编程提取这些不正常的位点的位置（所在染色体以及在该染色体的位置），不知道有没有哪位可以给小弟指引一下啊？ 数据的格式如下： >chrX 0 0 0 0 0 0 0 [...]...
十二月 1st, 2010 22:08 motianfeng
