现在想得到拟南芥和其他几个和它比较近的几个物种的multialignment文件。从哪里可以得到呢？ wormbase里面就有现成的文件供下载。在TAIR里面我没有找到。 谢谢！
Paulluke
|
Registered User
|
这家伙很懒，什么也没留下。 |
| 4 | Questions |
0
answer
11
views
3
answer
46
views
请问哪里可以下载到完整的拟南芥rRNA序列或者注释？
大家好： 我看到TAIR10的gff文件里面只有两个位点被注释成为rRNA，平均每个2000bp，我觉得rRNA不可能这么少。请问哪里可以下载到全部拟南芥rRNA的序列呢？ 谢谢！
四月 5th, 2012 19:15 Paulluke
6
answer
84
views
小RNA测序数据中小于多少copy number的reads被认为是测序误差造成的，所以舍弃呢？
大家好： 把测序数据uniq之后会得到每一条read对应重复了多少次。有paper说重复10次以下的read被认为是测序误差造成，要舍去。我的数据是拟南芥小RNA测序数据，里面有六分之一的reads其copy number都是一，这样舍去是否是太多了呢？ 谢谢。...
二月 4th, 2012 13:51 Paulluke
3
answer
38
views
Rfam中tRNA没有物种信息怎么办？
大家好。我现在想用拟南芥的测序数据比对Rfam中structural ncRNA，但是tRNA没有物种信息，我是直接用里面的9万多条tRNA序列拿来比对吗？tRNA虽然保守，可以这么做吗？我想是否应该有针对拟南芥的tRNA序列呢？
二月 3rd, 2012 10:36 Paulluke
