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primer3批量设计引物时总是提示input must be provided on standard input为什么？

soleadonis — Thu, 17 Feb 2011 09:22:10 +0000

primer3批量设计引物时总是提示input must be provided on standard input，格式检查过了，如下

PRIMER_SEQUENCE_ID=gi311063231_1
SEQUENCE=CCTTTGTTCTTTCTTTAAAATGGTTTCTTCTTCTTTTCCATTAACCCAAGTTTCACCTTCTTAATTCCTCTTTCATTTTCATCACTTCATGCATGAACTAGTTATCCTTAACCCTATATAAACTACCTATTTTCATCATTTTAACACTTCAATCATCCAAATCTAACATTTATTCACTTTTTCTCCTAAAGATATATACTATCTCTAAAAAAGATAGTTAAACACACACACACATATATATATATATATACACACAATATATATATATATATATATATGGGTTCAATGAATTGGTTAGGTTTCTCTTTATCTCCTCAAGAACTTCCTTCACAAACTCCTGATCATGGTAGTAATCAAGATCACCATCATCATCACTTTACAAGCAACAACAATGGAGAGTGTTTCGATCTCGGGCCCGGCTCAACGCCTCATTCTTCTCTCAATCACATCCCTTCTTCCTTTGGAATCCTTGAGGCCTTCCATAGATCAACTAATGATCAATCCCAAGATTGGAACAATATGAAGGGAAACTCAGAGCTTAGTATGCTAATGGGAAACCAAGAAGTTGAAGAGGAGCCAAAACTAGAAAACTTTCTAGGGAGTAGTCACTCTTTTAGAGAGAATCATCATCAAAATAATGGGGATCTCTACATGTTTAATACTACACATGATAACACAATAATAGTACTATGTCAACCCT
PRIMER_PRODUCT_SIZE_RANGE=100-280
TARGET=219,63
PRIMER_MAX_END_STABILITY=250

请柳城和各位高手再帮助给看看吧，谢谢！

有点相关的问题

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primer3批量设计SSR引物，p3_out.pl数据整合 (1.000)

如何给一个文本文件中多个FASTA格式序列改名字

soleadonis — Wed, 16 Feb 2011 03:57:19 +0000

>gi|312588551|gb|BQ591380.2|BQ591380 E012714-024-017-B15-T7 MPIZ-ADIS-024-storage root Beta vulgaris cDNA clone 024-017-B15 3-PRIME, mRNA sequence
TTTTTTTTTTTTTTTTGACGTCATGAACCAAACACTTGTATTATTCAGGAAGTTTGTAAGTACTAATCTT
TGTAACAAAAATCTTACAATGATCTTTATATCATATCTCATCACTCCCACCAATACTTCTGCTAGATACT
AATATAAAGATATATGTACAATGGAATCAACTTAACCCAAAATTCCCCGTTATTTTACACTGGTTTTTAC
TGAAGAATCTACGGAGGTTTTAAATCAATGTCAGAGGTTATTTTATCAACAATGCACCACCTTATTTCTA
TCAAAACATAATTTACGATAGACCCCACCATTTCTTCTCTTCTGCAAACTAATCATGAAACCCGCTTTCA
AACTCTCGAAGGCAAACCTTCTCAAGCTGTGTAGGCCAATCTTCTCCAAGGACTCGTGGATTAAGCTGCA
TTGCAGTCCGAAAGTCTAATATGGCTACTGAAGGAGGAGAAATGGGTTCCCTTAAGTGTCTTTCGGGCCA
AACTCCATTTAAACCAT
把其它字符全删去，仅留312588551；或者干脆从新命名123。有1000多条，需要从新命名或改名，请柳城和各位老师帮看看，怎么做？谢谢了！

有点相关的问题

如何批量设计SSR引物

soleadonis — Fri, 18 Jun 2010 13:44:04 +0000

您好！看了您的用misa和primer3结合使用批量设计SSR引物的帖子，从ncbi下了一个物种的EST序列进行SSR搜寻，misa分析完了以后，具体如何用primer3对misa的结果进行SSR引物的批量设计不会了，盼您能指点迷津！谢谢。