问题由http://yunbio.com/1640衍生！ seqlist 文件中有一些感兴趣的 ID total 文件是源文件（fasta） 目的是： 从 total 中根据 ID提取seqlist 中ID的所有序列！ [...]
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这家伙很懒，什么也没留下。 |
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请问怎么提取CDS上游500bp和下游500bp的序列
已经有CDS序列和基因extended序列（包括CDS、内含子、上游、下游） CDS.fa >c1 AABBCC >C2 CCDDAA >C3 BBAADD 。。。。。 基因ext.fas [...]
三月 29th, 2012 8:44 tempo8
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请问RNA-seq，DIGE-2D和GC-MS费用
想开展系统生物学方面的工作。 准备作4个样品（WT,mutant,WT处理，mutant处理）！ 请问RNA-seq，DIGE-2D和GC-MS费用各需要多少！ 谢谢！大致了解一下费用，我们要作预算！
三月 2nd, 2012 9:18 tempo8
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请教一个错位匹配找MOTIF的问题！谢谢
源文件是FASTA格式 >1EM2 GSDNESDEEVAGKKSFSAQEREYIRQGKEATAVVDQILAQEENWKFEKNNEYGDTVYTIEVPFHGKTFIL KTFLPCPAELVYQEVILQPERXVLWNKTVTACQILQRVEDNTLISYDVSAGAAGGVVSPRDFVNVRRIER RRDRYLSSGIATSHSAKPPTHKYVRGENGPGGXIVLKSASNPRVCTFVWILNTDLKGRLPRYLIHQSLAA TXFEFAFHLRQRISELGAR >gi4929573 MSTRAKKLRRIWRILEEEESVAGAVQTLLLRSQEGGVTSAAASTLSEPPRRT...
十一月 23rd, 2011 11:23 tempo8
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如何在windows下借助cygwin运行targetP-plant
项目需要：很多在线软件提供单机版，但是许多情况是LINUX平台，那么晕到死系统的菜鸟怎么倒腾呢？ 为了预测plant蛋白质的亚细胞定位，下载了targetp-1[1].1b.Linux.tar，解压到C:\targetp-1.1，并且搭建了在 Windows 上提供一个完整的 UNIX shell【cygwin】。 问题1：怎么样RUN？ 运行cygwin, 输入$ cygpath [...]...
八月 16th, 2011 14:56 tempo8
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如何用perl哈希整理excel多行多列（同KEY但Value不同）
PERL偶的情人啊！抓狂啊！ 下面的帖子是我的心路历程！新手不容易啊！ 项目目的：比如说一批空调(Gree, Haier, Chunlan……)在全国各地的（国美、苏宁、五星……）的价格，【sheet1/2/3分别对应北上广仨城市，ProbeName文件中有要调查的空调品牌，sheets中有空调=>卖场的价格情况】 但我只想知道北上广仨sheets整合后，ProbeName（仅Gree, Chunlan)在（苏宁、五星）的价格情况！ 三、EXCEL表格有上万条！ 品牌 [...]...
八月 3rd, 2011 9:53 tempo8
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如何批量定点提取序列
如何批量定点提取序列，即CDS-Genome作BLAST比对之后，要提取ATG上游2000bp的序列！ 如： 正链/正链（plus/plus） >subject1 Query 1 ATCG Subject 5186 tagc [...]
七月 1st, 2011 13:38 tempo8
