我想用bowtie，可是我的reads有部分长度大于1024bp，该怎么办？？望指点！

  match mis- rep. N's Q gap Q gap T [...]

#!/bin/python #Filename:sequence.py from Bio import SeqIO from Bio.Seq import Seq [...]

我想抽取部分序列，从start到end，但各个的start和end位置都不相同？我只会每个抽取全部的序列，望高手帮忙用python写个小程序！！我只懂点python，谢谢！！ list为： strand，id，start，end + 93688 0 156 - 58684 0 [...]

我做的是人AQP4基因外显子区域的SNP位点的分析，现在经PCR后的产物已经测系了。我们已经拿到目的条带并已经测系了，请问下步如何比对，找突变点了？？谢谢！需要详细的步骤，不会用BLAST，请详细指导，再次谢谢了！！！

求解答，万分感谢~~

最近我要写分子进化方面的论文，但有很多不会的，就查资料，看到资料中有下面的指标， 这些指标通过哪个软件得出的？另外这些指数值的大小范围是如何衡量进化树的可靠性？ 

在分析基因表达谱数据的时候，因为是二代测序得到的结果，想计算p-value，要用到edgeR。由于是初次使用，看英文说明不是很理解。第一步说读取数据，建立一个DGEList，可是按照他的例子我得不到结果。 想请教用过此软件的朋友，讲述一下大概的步骤，最好给出一个简单的格式。...

#!/bin/python #Filename:sequence.py #!/home/wangl/biopython-1.58 from Bio import SeqIO from Bio.Seq import [...]

各位，小弟看到文献有关于Gene Ontology，之前对这一方面根本就不了解，网上查了下也没有什么材料，可否请哪位高手指点下，弄个案例分析或者操作手册什么，能够详细分析Gene Ontology最好了，目前正在攻克英文主页，实在很吃力。

#!/bin/python #Filename:seq.py import time                  print time.ctime() def get_oneseq(gnl):         """ [...]

  有谁知道 barplot里的inside参数怎么用啊....老出现 警告信息： argument 'inside' is not used (yet) [...]

在特定物种基因组中Blast，获得登录号，点击登录号，然后点击graphics出现图形界面，点击sequence view，在sequence view里只能浏览序列，不能复制序列，请问有谁会不会在sequence view里复制序列啊

用一个query在特定物种基因组中搜索，获得的不同的登录号之间是否会包含同一条序列？

miRNA的conservation score是否能决定 lineage-specific miRNA families呀？