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对这些数据如何做个相关性分析??
数据1. 100009600_at 5.567630129 100012_at 2.347555989 100017_at 8.232722337 100019_at 7.311799648 100034251_at [...]
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求助 挑选序列--比对--进化树
1 从真核生物所有物种基因中,分别挑出所有内含子序列,外显子序列,CDS序列 2 分别比对这些序列 3 对结果做出进化树 小弟,在此谢过了。。
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如何做SNP在染色体的分布图
比如已经找出相关的SNP位点,然后想把这些SNP在染色体的位置画出来,有没有人知道怎么做? 谢谢!
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袁隆平的超级稻有没有申请任何基因专利?
不是特别清楚基因专利的申请,就超级稻本身来讲,它是遗传杂交的后代,基因早已不是wild type了,还能申请专利吗? 那么超级稻已经申请过专利了吗? 好像记得袁老师说不申请专利? [Edit] 这里提到“植物品种”是不能申请专利的,那基因专利就是针对未知的基因而言吗? 超级稻只是受益于已知基因的变异? 谢谢...
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有关blast的问题???
为什么我在linux下运行 blast 时老是断掉,,数据也不大,database 约120mb,怎么办好啊??求高手帮忙!!谢谢!!!
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如何生成随机序列
在做机器学习的序列分析的时候需要生成一些随机序列作为背景。但不知道该如何生成随机序列,我知道一般随机序列可以通过Shuffle或者随机生成的方式产生,有没有高手知道这两种方式该如何实现?本身倾向于用Shuffle方式,因为这样可以保证GC含量与原序列一致,最好是可以用perl语言,比较熟悉。 十分感谢^ _ ^...
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如何下载non coding RNA 在UCSC中??望高手指点!!谢谢。。
如何下载non coding RNA 在UCSC中??望高手指点!!谢谢。。
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有谁了解RNA-Seq在国内的发展状态?
BGI应该有做这个,其他的研究所呢? 一般用于什么的研究? 是用ad-hoc的生物信息分析方法,还是用成熟的pipeline多些? Pipeline是用国外的,还是自己开发? 谢谢
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GEOdatabase 下载
最近要在NCBI GEOdatabase 下载转录组数据 但是数据太大 有没有高手有快速下载的方法? thanks
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求解:Windows下如何安装和配置Blast
在下生物信息学底子比较薄,按照网上(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/staff/tao/URLAPI/pc_setup.html)说明,在Windows下安装了好一次Blast都没有成功。都是在最后测试阶段输入blastn -version命令可以显示版本信息,而blastdbcmd -db -refseq_rna -info 时会出现一些错误。 谁能帮一下忙,先谢谢了...
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如何在NCBI GEO中下载Microarray 序列,,我怎么找不到基因序列呢,找到的全是描述,望高手帮忙!!谢谢!!
如何在NCBI GEO中下载Microarray 序列,,我怎么找不到基因序列呢,找到的全是描述,望高手帮忙!!谢谢!!
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blast后的结果如何分析??怎么知道可靠的Identities??望高手指点。谢谢,
blast后的结果如何分析??怎么知道可靠的Identities??望高手指点。谢谢,
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请大家帮我看看这个程序报错是因为什么?
写的代码老是在given-when报错,抄了个书上的代码测试了一下,也报错,请大家帮我看看什么原因? 1 #!/usr/bin/perl 2 use warnings; 3 4 given($ARGV[0]){ 5 [...]
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大数运算
请问如何在perl中进行比较大得数的运算 比如100万左右的大数 是用模块吗