Recent Questions

3
answers
61views

如何批量删除一组序列中指定区段的序列,请求大侠帮助!!!

我想去除一组序列(大约1000条)中指定区段序列,例如 file1中包含原始待处理序列,格式和内容如下: >AT2G01210.1 MLASLIIFVALLCNVTVISGLN >AT2G01820.1 MSNSHLGTLCFIISLLGLANFSLS >AT2G01950.1 MTTSPIRVRIRTRIQISFIFLLTHL file2中包含指定区段信息,格式和内容如下: AT2G01210.1 [...]...

3
answers
66views

在R中,如何导入EXCEL表中遗传距离矩阵啊,谢谢!

各位大侠,小弟打算做一个Moran's I Autocorrelation Index检验,在EXCEl表中输入了成对物种间的遗传距离,但是,不知道该怎么导入R中,我按照普通的read.table()导入,结果,不能显示出数据时成对的矩阵,请各位大侠指点,小弟不胜感激!

0
answers
74views

R语言中对矩阵做交集

举例: a1=t(matrix(letters[1:10],nrow=2)) >a1      [,1] [,2] [1,] "a"  "b" [2,] [...]

0
answers
37views

用haploview的结果做LD衰减图需要做过滤处理吗

利用haploview得到了位点间的r2值,我想做LD 衰减图,是把结果里边所有的r2值都拿来用呢,还是有什么过滤条件之类的?谢谢大家

2
answers
60views

如何转换blast output的格式

在本地blast的时候,因为没有输入-m7的选项,结果出来是默认的格式,但是现在想把输出文件改成-m7的格式,不知道怎么实现?因为数据量比较大,不想再跑一次blast,谢谢!


19
answers
221views

如何批量的下载基因的start 和end数据

我通过表达谱芯片拿到一组差异表达的酿酒酵母的gene symbol 想找其在染色体上的start 与 end 例如:   start stop Symbol [...]

2
answers
93views

我是新手!~想问一下做DNA序列比对的那个blastn只有网页版的吗? 能下载软件吗?

RT 我听导师说 我们要比对的DNA序列要比对2 3天的时间 .... 如果有软件能不能给我发一个 我的邮箱是zhaozhiqiangg@126.com 刚涉及到这个 可能问题有点幼稚 请见谅

2
answers
73views

ncbi中的基因序号和phytozome中的基因是如何对应的?

请问各位前辈:ncbi中的基因序号和phytozome中的基因是如何对应的?我在NCBI上找到杨树基因ID如何找到拟南芥对应的JGI gene accession?有没有关于JCI的教程?

3
answers
70views

如何批量改数值小数位?

我有一个3G的文件,是phylip protdist得到的output文件,里面是一个15490*15490的矩阵,但是它们都是0.000000这样格式的,我想只要小数点后4位,如何运算呢? 数据格式如下:我知道perl里面有printf命令,但是我只会用split(/\s+/,$file),我想是不是可以用awk这样的快速的方法,由于数据太大(3G),所以,请各位帮帮忙!谢谢了! 15490 2GECDDH 0.000000 0.091953 0.282887 0.255746 0.591753 [...]...

1
answers
28views

fastacmd 参数-s中loci指的是什么

fastacmd中参数-s中loci值得是什么

3
answers
95views

fastacmd提取序列

blast 子程序 fastacmd能否按基因的起始位置和终止位置提取序列?若能其参数以及格式是什么?

2
answers
83views

UCSC 如何批量BLAT Search Genome 及如何批量下载

  UCSC 使用BLAT Search Genome的时候,提交序列文件限制是25条序列,有其他办法能进行序列数据批量比对到基因组中么?非本地进行blast的

0
answers
39views

请教一个错位匹配找MOTIF的问题!谢谢

源文件是FASTA格式 >1EM2 GSDNESDEEVAGKKSFSAQEREYIRQGKEATAVVDQILAQEENWKFEKNNEYGDTVYTIEVPFHGKTFIL KTFLPCPAELVYQEVILQPERXVLWNKTVTACQILQRVEDNTLISYDVSAGAAGGVVSPRDFVNVRRIER RRDRYLSSGIATSHSAKPPTHKYVRGENGPGGXIVLKSASNPRVCTFVWILNTDLKGRLPRYLIHQSLAA TXFEFAFHLRQRISELGAR >gi4929573 MSTRAKKLRRIWRILEEEESVAGAVQTLLLRSQEGGVTSAAASTLSEPPRRT...

0
answers
14views

adobe free

adobe free

winrar 3 download

winrar 3 download freedownload

windows 7 free

windows 7 crack

key office 2010

office 2010 key

download photo shop free

photo shop serial

corel dvd moviefactory 6

corel dvd moviefactory 6 downloads

free corel photoshop download

free corel photoshop download keygen

photoshop key

photoshop key

free corel downloads

free corel downloads cracked

free winrar download for xp

download winrar for xp for free

serial corel draw 11

serial corel draw 11 serials

windows 7 key

windows 7 key

photo shop key

photo shop key

winrar password cracker serial

wirar password cracker

serial winzip 11

serial winzip 11 key

cs5 serialz

cs5 serialz free

office 2010 professional key

office 2010 key

office 2010 free

office 2010 key

windows key

windows key