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华大基因生物信息学前沿技术专题培训班
华大基因生物信息学前沿技术专题培训班 从2000年完成第一个人类基因组图谱以来，在短短十一年的时间内，基因组的技术和科学取得了巨大进展，所产生的巨大的生物信息数据使得生命科学进入一个以基因组为基础的数字医学或数字生命科学时代，并已成为21世纪生命科学的主流技术领域。 您是否还站在基因组学的门外徘徊？您是否还在为海量的数据却苦于不知从何着手分析？您是否还在为软件繁杂的使用方法和众多参数而不知如何取舍？赶快参加华大基因生物信息学前沿技术培训班吧，通过本期培训班把您领进生物基因组学的大门，还可以让您了解生物信息学前沿概况、熟悉第二代测序技术原理，并系统地了解生物信息学的基本分析思路（包括组装、注释和进化分析），同时了解第二代测序技术在重测...
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生物信息学前沿技术专题培训班-第四期
个世纪90年代以来，以生物技术、信息技术为代表的前沿科学，把人类领入一场全球性的科技变革。生物前沿技术的高速发展更是为人类开启了一扇崭新的大门，带动着当代生物界跨越式迈进。生物研究日新月异的成就璀璨如星，同时，也指明了人类生物界未来发展的方向。 新的生物技术带动着研究者们不断更新其知识储备和技术掌握的能力，这些能力也益加成为了研究者们向未来进发并引领生物潮流的武器。换句话说，当今时代，谁，走在了科学技术前沿，谁，将更有可能引领生物界未来的发展。那么，您的前沿技术水平是否已经与时俱进了？ 欢迎您来华大基因参观学习生物信息学前沿技术！ 华大基因科研项目一线研究人员精心组成讲师团队，为您搭建一座崭新的科研技术平台。通过学习，您将了解生物信...
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微生物专题研讨班
自启动“万种微生物基因组计划”以来，华大基因在微生物基因组研究领域又取得了新的突破。近期，由深圳华大基因研究院和德国汉堡—埃普多夫大学医学中心等单位主导的德国致命性大肠杆菌研究项目首次展示了快速的基因组测序技术和及时的数据共享给全球各科研领域所带来的巨大贡献，证实了信息数据的快速共享在公共卫生事件中可发挥至关重要的作用，同时也为应对全球重大突发性紧急公共卫生事件提供了一个全新的解决思路，为全球其他传染性疾病的应对机制提供了一个新的国际协作模式。 为了向广大研究人员提供新的研究思路、研究策略和技术方法，把华大在新技术、新方法的不断探索中总结的经验和教训分享给大家，华大基因特举办了微生物专题研讨班，聘请深圳华大基因研究院该领域的学术带头...
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生物信息学必备技能班
华大基因生物信息学必备技能班于2011年暑期推出后，迅速得到广大研究人员的认同及肯定，为了让更多地研究人员了解生物信息学基本原理及实用工具，生物信息学必备技能班第二期即将拉开帷幕，还等什么呢？马上报名参加吧！ 您还在为如何编写简单的脚本进行生物信息学数据的基本分析而惆怅吗？您还在苦于如何将有用的结果数据绘制出满意的图表吗？来加入华大基因生物信息学技术培训系列之必备技能班吧，在这里您将学习两大生物信息学实用工具——Perl语言和免费、开源且功能强大的绘图工具R。通过将Perl语言的基本知识与生物信息学应用相结合，将使您了解Perl的基本规则及函数并初步学会编写简单的生物信息分析程序。R语言将让您学会如何利用功能强大的绘图工具绘制理想...
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生物信息学前沿技术专题培训班
上个世纪90年代以来，以生物技术、信息技术为代表的前沿科学，把人类领入一场全球性的科技变革。生物前沿技术的高速发展更是为人类开启了一扇崭新的大门，带动着当代生物界跨越式迈进。生物研究日新月异的成就璀璨如星，同时，也指明了人类生物界未来发展的方向。 新的生物技术带动着研究者们不断更新其知识储备和技术掌握的能力，这些能力也益加成为了研究者们向未来进发并引领生物潮流的武器。换句话说，当今时代，谁，走在了科学技术前沿，谁，将更有可能引领生物界未来的发展。那么，您的前沿技术水平是否已经与时俱进了？ 欢迎您来华大基因参观学习生物信息学前沿技术！ 华大基因科研项目一线研究人员精心组成讲师团队，为您搭建一座崭新的科研技术平台。通过学习，您将了解生物...
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疾病专题研讨班
传统的疾病研究模式，是以假说为导向，即首先假设某基因为致病候选基因，再对其进行深入研究，一次只能研究单个或几个基因。而现代的重大疾病的研究模式，是以数据为导向，对物种或个体进行基因组水平、大规模化研究，即在掌握基因组全局的情况下，发现影响疾病的基因位点。 人类基因组计划使我们能够更好地了解自己的基因和基因组，但它仅仅是一个开始，新一代测序技术的产生和发展为疾病研究带来了新的机遇。利用高通量测序技术，研究者能够在DNA水平、RNA水平、表观遗传学水平对疾病展开全方位的研究。在DNA水平，包括全基因组重测序、外显子组测序和个性化目标区域测序等技术；在RNA水平，通过RNA-Seq测序技术和小RNA测序等技术，能够实现复杂疾病的分型、分子...
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生物信息学工作者在Windows中高效处理文本数据
生物信息学工作者大多数时候面对的都是纯文本数据（电子表格可以导出为纯文本），如果你在Linux平台下工作，系统自带的命令足以方便、高效得解决很多 问题。但如果你工作在Windows平台下，就没那么幸福了。如果你觉得自己算是Excel高手，那就继续使用它吧；如果你想更加简便、更加灵活得处理这 些纯文本数据，还需要另辟蹊径。 下面是我推荐的一些工具（除galaxy外，基本上推荐程度递减）： MobaXterm GNU utilities for Win32 CoreUtils [...]...
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生物信息学专题研讨系列--转录组、小RNA专题
您的研究方向遇到瓶颈了吗？身边没人能对转录组/小RNA和您讨论学习了吗？技术知识程度更新已经不够了吗？老板对您目前的研究进程不满意了吗？ 和我们华大基因研究院的培训团队们联络，来参观学习吧！ 在这里，我们将为您呈现转录组和小RNA的领域带头人精心炮制的精彩专题。在这里，我们的老师将深入传授您每个专题的理论与实践，剖析案例。在这里，您会发现业界中与您同样优秀的同袍和精英。在这里，我们定能让您能学有所获，学有所用！ 为保证学员学习质量，我们均对每期的学习人数加以规定和限制。因此，为了满足广大未能报上名的学员对专题培训的需求，特此加班。 还等什么，点击报名，来加入我们的专题盛会吧！ [...]...
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生物信息学技术培训系列--必备技能班
生物学的绽放，如释放潘多拉魔盒。多样、丰富、创新、发现充斥着现代人生活，也改变着我们的未来。 当我们怀着豪情壮志遨游在生物界的开疆扩土时，快速发展的技术和知识也成为了我们的必备武器。每一次，日新月异的技术知识都会使生物界拥有跨越式的发现和突破。 而，某个时刻，您的研究进程是否也会因技术水平阻碍而裹足不前？当您灵感闪现，迫切的需要运用技术手段去验证的时刻，您是否也因某些软肋而困扰惆怅？当您打开生物杂志，看到别人的发表文章和署名，你是否会因为仅是自己某个牵绊导致落后于人而望洋兴叹？ 不要让“短板”成为你破土的壁垒！不要让“短板”制约你前进的脚步！你，准备好了吗？！你，已经武装上阵了吗？！ 我们就在这里！只为要夯实基础的你，只为明天能驰骋...
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一个处理序列的Perl脚本
源数据： 说明：1 >开头的为注释行，包含序列ID等信息 2 注释行下面两行是含有SNP的两个序列，末尾的数字是测序深度 3 *指示SNP的位置 目的：筛选测序深度均大于15，SNP为1的成组序列。输出格式为序列ID+序列信息。 Perl脚本： [...]
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2011最新的SCI期刊影响因子Impact Facto下载与查询
6月28号，2010 Journal Citation Reports®（JCR，期刊引用报告） 发布了2011/2010最新的SCI影响因子报告。 每年的年度 SCI 期刊的最新影响因子会在下一年度6月中旬左右出来。因此，2011年的 SCI 影响因子，实际应该在2012年才会出来。这次出来的影响因子则是统计的 2010年度的 [...]...
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[专题]NGS（第二代测序）文献汇总
序： 下面是我认为比较重要的一部分文献，但个人所知有限，希望能够群策群力，继续补充完善，帮助别人、也帮助自己。 { }是分类，行首的[ ]表示软件名。 分类不是很清晰，有待完善。 {GENERAL} Zhang, J, [...]
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加拿大研究发现：频繁使用手机导致男性生育力降30% 【生物探索】
转自：生物探索 http://www.biodiscover.com/index.php?r=article/view&id=83128 据***近日报道，世界卫生组织(WHO)下属的国际癌症研究机构(IARC)称，手机“有可能致癌”。而一项最新研究警告，频繁使用手机的确会降低男性 生育能力。据国外媒体6月21日报道，加拿大一项新研究发现，频繁使用手机(包括非通话状态)会导致男性生育能力下降30%。 现代生活中，手机使用越来越频繁。（图） 由加拿大皇后大学科研人员完成的这项新研究显示，长期使用手机或遭受手机释放的电磁波辐射的影响，男性精子质量会下降，精子数量会减少。研究人员表示，使用手机会加速男性体内睾丸激素的循环，但是与此...
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对FASTA格式的简单处理与统计的Perl程序
缘起 模仿lh3开发的网页版工具SeqTools 功能 1.格式化FASTA文件。 2.反向互补FASTA序列。 3.获取FASTA序列的长度。 4.计算GC含量并对ATGC计数。 5.搜索模式（子序列、motif等）。 改进 1.添加了GC含量的计算和ATGC的计数。 [...]
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获取基因组的子序列
大家好，我写了一个小程序，用来在线获取、本地保存基因组的子序列（如获取hg19的chr1:1000-10000），希望对大家有所帮助。详情参看（附有原始脚本下载）：http://yixf.name/2011/05/14/%E8%8E%B7%E5%8F%96%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E7%9A%84%E5%AD%90%E5%BA%8F%E5%88%97/ 下面是全部的代码： #!/usr/bin/perl use strict; use warnings; use Getopt::Long; use [...]...
