我用mega4构建的进化树好像有些问题。换了很多种model和方法得到的bootstrap值都有些特别小的值，有的分支甚至为0.按道理的话这样得到的树是不可信的。我看文献一般得到的树的bootstrap值都在90~100之间。我的问题究竟出在哪儿呢？该怎么改进？烦请赐教啊~ 我多重比对的序列大概有15条左右（也试过只建树其中的某几条序列），均属一个科的序列（主要为该科的三个不同的种），是用同一对引物扩增同一个编码区后获得的片段，长度均在300左右，彼此长度差异很小，多重比对和建树（NJ和ME MP 都试过）的参数为默认，bootstrap的replication值勾选的是1000和2000甚至5000都试过，不胜感激！...

各位老师 如何设计以慢病毒为载体的micoRNA反义寡核苷酸序列？公司给我设计的是什么 意思？ 我不明白设计反义寡核苷酸序列是否同设计正义序列一样需要PCR扩增前体(pre) 步骤??是扩增前体后设计的反义序列么、。？希望大家有空帮我分析下，万分感 激？谢谢了 以下是公司为我设计的目的基因片段 目的基因片段的获得： 引物合成 1.hsa-mir-xx-AgeI-F: [...]...

Sall4 Sall1 Zfp219 Arid3b Wdr5 Zfp462 Sox2 Mga Ubp1 Nac1 [...]

大家好，我是刚接触分子实验的菜鸟，最近想找珊瑚的cyt b 基因和D-loop基因的扩增引物，可是查到的文献又不能全篇阅读，去NCBI又不会查（英文太差），请问能帮我查一下吗，复制粘贴给我；有相关文献的能不能也给我，我愁死了了最近。 请发到邮箱：ｄａｊｕｍ７７７＠２１ｃｎ．ｃｏｍ　　　万分感谢！！ 还有扩增出来后，如何分析？　　　我是做好多种珊瑚的分子分类。...

您好！看了您的用misa和primer3结合使用批量设计SSR引物的帖子，从ncbi下了一个物种的EST序列进行SSR搜寻，misa分析完了以后，具体如何用primer3对misa的结果进行SSR引物的批量设计不会了，盼您能指点迷津！谢谢。

如果想要写ncbi上和数据格式方面的论文，应该从哪些方面入手呢？主要可写的有哪些方面？

请教个问题,我用perl匹配gbk文件，文件是多个gbk文件的集合，首先想吧annonation和dna分别匹配上，并且输出，更改了$/的值为每个GBK记录结尾的//，所以，一个record就是一个GBK文件，可是匹配完了发现，只能匹配上第一个记录，后面的都为空，实在搞不清怎么回事！源代码如下，求助！！！ my $filename = '3testseq.gb'; unless (open(GBFILE, $filename)) { print [...]...

http://seqanswers.com/ the next generation sequencing community. 虽然速度比较慢，但资源挺多的。

有没有人做生物信息学数据整合研究的？

有时简并碱基出现在3'端的引物中，对PCR扩增影响如何？ 还是同时设计两条引物（不用简并碱基）对扩增结果比较好？