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数据图形化之如何画exon/intron
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新学perl，有个问题，请各位大侠帮个忙~~
这有两列数： 1 A 4 B 3 C 4 D 5 [...]
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如何随机抽取基因序列？
大家好，如何从fasta文件中随机抽取序列？比如100条。谢谢
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How to install mutationseq
有没有哪位使用过mutationseq这款软件啊？怎么安装啊！请高手指点一下！ 想先在个人笔记本上试安装，centos6.0，没有安装matlab。
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新手求助！求大侠帮忙~~
怎么用perl程序，随机生成一条序列，使ACGT四种碱基的含量分别为0.3，0.3，0.2，0.2！ 非常感谢~~~
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关于基因芯片探针对应基因模型编号
各位大侠，最近在分析基因数据。小弟遇到一个问题，就是怎么把探针号和基因模型编码对应起来。 在公司提供的编码中对应有由ENSEMBL产生的编号，但是这个不是官方编号。我用的是 Affy的杨树芯片。 比如： Ptp.1010.1.A1_s_at对应的是POPTRDRAFT_639895，但是我需要的是有JGI产生的POPTR_0647s00220。...
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预测miRNA的转录因子结合位点
问题求教。 有人做过预测调控miRNA的转录因子位点没有啊 一般用什么方法哦 提取miRNA上下游多长的序列进行预测比较合理呢 我查到 有调控miRNA的转录因子的数据库 比如 北大的transmiR ,CircuitsDB等 我还没有查到预测miRNA的预测转录因子结合位点的具体思路 求教...
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请问，如何在NCBI中搜索一个基因家族的全部成员？
我想寻找水稻中某个基因家族中的全部成员，我在NCBI的protein库中搜索，得到133个结果，其中有很多为unnamed protein product 或者是hypothetical protein ，我同时在uniprot库中输入同样关键词，可以搜寻到64个结果，在NCBI gene中输入，只找到15个结果，还有一个提示说“This record was discontinued”。请问，为什么不同的库结果会相差这么多，还有，我应该怎么正确的寻找呢？谢谢大家！...
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关于single repeat motif
大家好， 用软件预测DNA序列的motif, 有时会发现单一碱基重复的motif，如AAAAA... （>10）。我注意到，很多文献会把此类motif删除。我的问题是，为什么要去掉这类预测结果呢？是因为该类基序不能结合TB? 谢谢！
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请问哪位用过tbl2asn这个软件吗？
我想向NCBI提交一个基因组序列，需要用tbl2asn这个软件，但是打开后无法输入指令，按任何一个键都会自动关闭。请问哪位用过这个软件吗？能不能教教我？多谢各位！！ 我的邮箱是duyuhui_107@163.com 望大家帮忙，万分感谢！！
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bioruby bioperl biopython
不知何故，bioruby的官网访问不能（http://bioruby.org）。 python的用户很多，perl算是新起之秀。但是ruby的用户似乎较少，在论坛里搜索ruby关键词都没有任何条目。可本人看过ruby之后，觉得ruby比perl还更加随性，更加配得过脚本语言的名字。 求一份bioruby的论坛或者讨论组。bioruby的wiki貌似做的也很一般，让我觉得ruby在bioinfo貌似真的很冷。难道是说既然是脚本流语言，有perl、python了也就没所谓用ruby了麼？...
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那位知道这一类基因家族在多染色体上分布的图是如何画的?
希望大家能够说得详细点，谢谢！！
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转录组:基因表达量差异分析
如何用转录组数据做基因表达量的差异分析，并把那些表达量差异显著的基因挑出来？ 现有两个近缘物种的转录组数据，想挑出那些表达量差异显著的基因，请问大致的步骤是怎样的，还望做过的前辈不吝赐教，不甚感激。
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pathway 里含有的基因
有没有人知道在哪里可以得到各种pathway里的所有gene id？谢谢！
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如何批量下载SNP位点在中国人种（HCB）的等位位点频率？
如题所述，我有50个左右的SNP位点的rs号 我想找到其在中国人种中的突变频率 与我自己检测的100例样本做一个统计显著性差异检验（卡方检验） 问题是 我用batch entrez在NCBI的SNP数据库内没有找到中国人的突变频率。 rs1042522 rs1042526 rs10487888 [...]...
