先要多谢一下 Sophie 与 rebeccajiejie 的热心，让 云生物 看起来着实有些了活力。也希望更加的人参与进来回答问题。得开始认真宣传一下才行啊。 最近Sophie问了我关于批量Blast的问题。我尝试了一下NCBI的批量Blast，感觉非常不错。 写个教程分享一下。拿水稻的序列Blast做个例子。 Batch entrez [...]...

这种图是用啥软件画的啊？

云生物（http://yunbio.com/），是有关生物学，特别是生物信息学相关的一个快速问答系统。此系统的推出是要聚合大家的智慧，一起来解决大家的难题。正所谓集思广益，三人行必有我师。

如图。这个是什么软件做的。貌似很流行的样子啊

终于可以发帖了！。。。。 我想用perl批量处理一批序列文件，就是每个序列单独一个文件，大概一百多个文件，想写个程序，把所有文件批量打开，做处理，然后再关上，改原文件或者生成个新文件都可以。 但现在不知道怎么能一次打开很多文件，文件句柄可以是变量么？...

我现在想把MEME本地化预测Motif，在Ubuntu下安装时，到”make test”这一步就总是显示有一项错误，谁知道怎么解决？安装过MEME的给个建议，谢谢

dna序列能直接去orf finder么？ 我觉得这个问题好弱啊，但是我真的迷糊了。虽然有内含子序列，但是orf是基于起始密码和终止密码来的吧，那用dna得到的orf的部分应该和cdna去检测的结果差不多吧？

我不是去做水稻，是做芒草——生物能源。希望今天早上不要中暑。

如何在windows7系统下进行大批量的blast。最好不要是linux系统的。之前曾经捯饬过这个系统，但是终究还是没有结果。 Ps，关于之前提到的“RM1~600是水稻的EST序列”，经过验证，我发现这句话不算正确，因为我在EST序列里面根本找不到序列，弹出来的只是GSS的相关信息。 我会再向提供信息的老师确认，并尽快将我认为正确的信息告诉大家。希望博主先把我之前的那条回复先删除了，免得引起别人的误会。文章题目是：武汉的温度持续上升到29度。 有劳博主。...

之前曾经问过Liucheng有关如何将序列定位在染色体上的问题，得到回复之后，觉得应该将他提到的那个疑问贴出来一下，就算也让大家也知道一下NCBI确实是提过这个建议的，尽管我搞了半天愣是没有看懂。呵呵。欢迎大家鉴赏一下啊。也请大家帮忙解决以下我这个问题——如何将序列定位在染色体。不甚感激！ 以下是这个建议的website。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/help/genefaq.html 其中重要的部分我截过来。 Ps,注册这个网站之后，我咋觉得，我们都将是未来的网站元老呢，呵呵，鉴于这个自私的想法，所以就立马添了一篇文章。呵呵……...