先要多谢一下 Sophie 与 rebeccajiejie 的热心，让 云生物 看起来着实有些了活力。也希望更加的人参与进来回答问题。得开始认真宣传一下才行啊。 最近Sophie问了我关于批量Blast的问题。我尝试了一下NCBI的批量Blast，感觉非常不错。 写个教程分享一下。拿水稻的序列Blast做个例子。 Batch entrez [...]...

这种图是用啥软件画的啊？

如图。这个是什么软件做的。貌似很流行的样子啊

终于可以发帖了！。。。。 我想用perl批量处理一批序列文件，就是每个序列单独一个文件，大概一百多个文件，想写个程序，把所有文件批量打开，做处理，然后再关上，改原文件或者生成个新文件都可以。 但现在不知道怎么能一次打开很多文件，文件句柄可以是变量么？...

he miRBase http://microrna.sanger.ac.uk/ TargetScan http://www.targetscan.org/ PicTar http://pictar.bio.nyu.edu/ 如何在targetscan等数据库查hsa-mir-21基因的结合位点与那些疾病 的基因重叠啊，或相关。我在这几个数据库也没找到啊 ，请各位战友 [...]

不定期的推荐资源。推荐牛人的博客。正所谓术业有专攻啊。欢迎大家有好的资源也一起推荐。 ============ 原标题：单核苷酸基因多态性（SNP）研究中的选点方法 原文链接：http://www.ifanqie.org/archives/324.html 博客作者：番茄芝 博客url：http://www.ifanqie.org/ ============ 单核苷酸基因多态性（SNP） 最近也开始接触这方面的东西，一切都在慢慢的学习，从选点开始，到酶切，tagman分型，到SPASS，SAS统计都是一个个的过程，为了学习+复习，分享一下学习到的选点的方法，进宫参考，高手勿笑。 1．  [...]...

柳同学，讲下kegg的用法吧

如何在windows7系统下进行大批量的blast。最好不要是linux系统的。之前曾经捯饬过这个系统，但是终究还是没有结果。 Ps，关于之前提到的“RM1~600是水稻的EST序列”，经过验证，我发现这句话不算正确，因为我在EST序列里面根本找不到序列，弹出来的只是GSS的相关信息。 我会再向提供信息的老师确认，并尽快将我认为正确的信息告诉大家。希望博主先把我之前的那条回复先删除了，免得引起别人的误会。文章题目是：武汉的温度持续上升到29度。 有劳博主。...

在NCBI获得的FASTA格式的序列，如果要保存到本地的txt.格式的文件中，是不是还需要自己手动一个一个的复制粘贴到文件中保存，有没有批量下载保存到txt.的方法？

您好！看了您的用misa和primer3结合使用批量设计SSR引物的帖子，从ncbi下了一个物种的EST序列进行SSR搜寻，misa分析完了以后，具体如何用primer3对misa的结果进行SSR引物的批量设计不会了，盼您能指点迷津！谢谢。

dna序列能直接去orf finder么？ 我觉得这个问题好弱啊，但是我真的迷糊了。虽然有内含子序列，但是orf是基于起始密码和终止密码来的吧，那用dna得到的orf的部分应该和cdna去检测的结果差不多吧？

GO便是Gene Ontology。 前言请看：如何在NCBI实现大批量数据的一一对应 corelboy 的问题 帮他AD一下先：欢迎访问我的网站 http://www.bu-pathology.com ，我主要是做病理和医学图像分析的 想请教一下，这些大批量的数据在Linux下如何对应的具体操作步骤。比如我有一个list的geneID 我想跟GO [...]...

用MEGA处理Clustalw的比对结果，完成格式转换后，导入MEGA生成有bootstrap值的进化树，发生错误，提示NO COMMON SITES FOR COMPUTING DISTENCES，看帮助文件也没看懂，请问这种情况怎么处理？或者说用clustalw处理的aln文件怎么生成有bootstrap值的进化树？

在查看进化树文件时，发现在计算距离是出现0或者是负值，个表示什么意思呢？进化树是用clustalw程序做的！谢谢

云生物（http://yunbio.com/），是有关生物学，特别是生物信息学相关的一个快速问答系统。此系统的推出是要聚合大家的智慧，一起来解决大家的难题。正所谓集思广益，三人行必有我师。