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motif搜索结果的含义

      我用gimmemotifs搜索motif得到这样的图示结果,可是下面对应的GTrkATwTG中r、k、w的含义不知道是什么意思,在这个软件的说明中也没有找到对应的说明,不知道有没有知道的。

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怎么编程找出比对序列最佳匹配?

     有许多基因,想找出编码序列和内含子序列比对的最佳匹配序列,次强序列,次次强序列。。。。?怎么编程,那大侠有空帮帮忙。

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有关网站的推广,大家提点意见建议?

你认识的朋友同事有人在用这个网站提问回答问题吗? 你会把它告诉你的朋友同事吗? 你觉得网站有哪些不足, 如何改进?   个人感觉网站的界面稍微有点混乱.  不知能不能效仿知乎,请一些大牛来这里  

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我这个程序为啥没进入循环,仅抽出了第一个的部分序列??望高手帮忙!!

#!/bin/python #Filename:sequence.py from Bio import SeqIO from Bio.Seq import Seq [...]

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[公告]云生物:快速问答系统强势推出

云生物(http://yunbio.com/),是有关生物学,特别是生物信息学相关的一个快速问答系统。此系统的推出是要聚合大家的智慧,一起来解决大家的难题。正所谓集思广益,三人行必有我师。

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请问,怎样查询和定位scaffold具体在哪条染色体上?

由于任务需要,我现在需要定位Populus trichocarpa scaffold_118在其基因组的位置(具体到是在哪条染色体上),请问我需要怎么做?NCBI吗,我知道,可是找不到,所以求助各位同仁!谢谢大家!

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如何在NCBI GEO中下载Microarray 序列,,我怎么找不到基因序列呢,找到的全是描述,望高手帮忙!!谢谢!!

如何在NCBI GEO中下载Microarray 序列,,我怎么找不到基因序列呢,找到的全是描述,望高手帮忙!!谢谢!!

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生物信息学前沿技术专题培训班

上个世纪90年代以来,以生物技术、信息技术为代表的前沿科学,把人类领入一场全球性的科技变革。生物前沿技术的高速发展更是为人类开启了一扇崭新的大门,带动着当代生物界跨越式迈进。生物研究日新月异的成就璀璨如星,同时,也指明了人类生物界未来发展的方向。 新的生物技术带动着研究者们不断更新其知识储备和技术掌握的能力,这些能力也益加成为了研究者们向未来进发并引领生物潮流的武器。换句话说,当今时代,谁,走在了科学技术前沿,谁,将更有可能引领生物界未来的发展。那么,您的前沿技术水平是否已经与时俱进了? 欢迎您来华大基因参观学习生物信息学前沿技术! 华大基因科研项目一线研究人员精心组成讲师团队,为您搭建一座崭新的科研技术平台。通过学习,您将了解生物...

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如何快速上手microarray的数据分析工作?

没有生物背景,如何快速上手运用BoiPython程序进行microarray的数据分析工作?谢谢。

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插入代码或序列、及上传图片演示

最近升级了 编辑器,ckeditor+ckfinder+syntaxhighlight的组合。 这里示例一下插入代码或序列,及上传图示的问题。 特别是 插入代码及序列,最好是规范一下的。因为序列太长,直接粘贴非常不美观的。   1,插入代码 或 序列 示例: [...]

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关于pathway预测的问题

大家好,最近导师给了个课题,主要是在不使用以往Pathway作为模板的情况下做pathway预测。于是我想通过Gene的属性做一下聚类,苦于找不到与gene功能相关的属性,不知有没有XDJM可以提供下帮助,谢谢。

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求助,进化树

选5个原核,5个真核rRNA序列,求出5-mor的频数,用距离dij=pi-pj (n=5)的模糊聚类方法导出进化树 越详细越好。

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继续发个图的问题

如图。这个是什么软件做的。貌似很流行的样子啊

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Clustal X比对中比对不完全的问题

之前使用ClustalX,都没有出现问题,但这回我使用的是500-800条的序列,fasta文件中包含引物A扩增产物、引物B扩增产物和标准全长序列,使用完全比对,发现引物B的序列都出现了位置错配,本该与标准序列的400bp处开始匹配,但是好像没有比对过似的在开始的100bp就对齐了,并且后续的碱基也与其他类别的序列没有对齐。这类序列单独比对的时候是没有这个问题。难道对于这种比对,需要修改比对参数吗?我都是默认设置。realign也是同样的结果。 希望哪位行家予以解答。 图示是我比对的部分展示:其中下半部分是我所说的引物B的序列,很明显与中间的以及上部的引物A的序列比的乱七八糟。实际上,这些序列是有高达96%的相似度的。...

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药物基因表达谱怎么获得?

我想知道一种药物的基因表达谱和它所作用的细胞系,该查那个数据库可获得呢?用GEO行吗?不会找求高人指点!

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