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请问预测假基因有没有什么比较方便的方法
我现在有整个基因组的序列，不过没有完整的拼装成一个个的染色体，基因的预测也已经完成了。现在需要预测假基因，请问有没有什么比较方便的方法？ 我试过PPFINDER和pseudopipe，不过都用不了，pseudopipe需要Ensembel mysql的一些信息，PPFINDER需要和另外一个基因组的synteny比对的信息。 是不是需要自己来根据算法来写程序呢，现在老板催的比较紧，请大家知道的提示一下，谢谢了...
