云生物 » 拟南芥 http://yunbio.com 生物信息学(Bioinformatics)的快速问答系统 Thu, 17 May 2012 02:15:39 +0000 en hourly 1 http://wordpress.org/?v=3.3.1 拟南芥基因上游序列下载 http://yunbio.com/1240 http://yunbio.com/1240#comments Wed, 15 Jun 2011 08:18:19 +0000 xingzhou823 http://yunbio.com/?p=1240 我现在只知道拟南芥的探针名称，
例：
246994_at
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254338_s_at
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263757_at
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怎么才能下载到其基因上游（比如upstream1000bp）序列？
我想把他们的基因序列下载并保存为 fasta格式


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]]> http://yunbio.com/1240/feed 3 怎样可以批量下载特定拟南芥的基因序列。 http://yunbio.com/1182 http://yunbio.com/1182#comments Sun, 05 Jun 2011 13:06:29 +0000 wutomg http://yunbio.com/1182 我想批量下载拟南芥的一些基因序列，例如AT1G64100 AT2G03220 AT2G03210 AT1G14070 AT3G03580等等。直接把基因号输入NCBI的gene搜索中显示没有相应的基因。问题在哪？应该在哪如何下载呢？请高手指教。


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]]> http://yunbio.com/1182/feed 6 不同物种转录子序列查找 http://yunbio.com/55 http://yunbio.com/55#comments Sat, 10 Apr 2010 05:01:33 +0000 skycc1986 http://yunbio.com/55 我想查找葡萄中的SBP转录家族的序列信息，不知道怎么找，能教教我么。

我看了些文章，但是都不详细，我试过两个方法，就是不知道对不对，接下去怎么处理。

一个是，拿拟南芥转录家族的所有基因对葡萄EST数据库进行比对，然后将结果进行拼接，但这样，还是得到很多序列

二是，那SBP domain 氨基酸序列对葡萄EST数据库进行比对，结果再进行拼接，这样得出的序列较少，但是这些序列的CDS序列以及氨基酸序列我不知道该怎么查找出来了，而且要和拟南芥做聚类分析以及氨基酸比较分析，我不知道这些序列对应拟南芥哪些序列进行分析？

在线等求教。。。。。


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