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求助:如何从众多数据中提取数据的坐标信息
各位大虾,现在我有一个好几G的关于23条染色体上每个碱基位点测序深度的数据,但是有些位点的测序深度太离谱,明显超出了正常的范围,有些地方甚至过万。所以,想通过perl编程提取这些不正常的位点的位置(所在染色体以及在该染色体的位置),不知道有没有哪位可以给小弟指引一下啊? 数据的格式如下: >chrX 0 0 0 0 0 0 0 [...]...
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如何根据部分基因注释信息找到染色体上所有的基因的cds呢....
导师给了Y染色体4个基因的注释信息,但是题目却让我找到所有Y染色体上的基因的CDS,是不是我听错了,还是真的可以找到啊....
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从一条染色体中取特定的序列
chr1 atctaaaggggccccccccc........(文件大小是160M) 现在想取其中一段序列,比如123456bp-12345678bp的序列 由于是一般的电脑,只有2G内存,因此bioperl的模块用不了,内存存不了那么大的序列,这种情况下怎么才能把序列取出来呢? 谢谢大家帮帮忙!