我看了些文章，但是都不详细，我试过两个方法，就是不知道对不对，接下去怎么处理。

一个是，拿拟南芥转录家族的所有基因对葡萄EST数据库进行比对，然后将结果进行拼接，但这样，还是得到很多序列

二是，那SBP domain 氨基酸序列对葡萄EST数据库进行比对，结果再进行拼接，这样得出的序列较少，但是这些序列的CDS序列以及氨基酸序列我不知道该怎么查找出来了，而且要和拟南芥做聚类分析以及氨基酸比较分析，我不知道这些序列对应拟南芥哪些序列进行分析？

在线等求教。。。。。