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本地化blast的问题
大家遇到过could not calculate ungapped karlin altschul parameters due to an [...]
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从blastx结果中提取编码区
柳同学好 你已经介绍过很多本地blast的方法 我从你这学会了很多东西 很高兴 有个问题想请教大家，有没有什么办法可以从blastx中将query的编码区提取出来？
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blast结果求交集
现在手上有10个blastn －m 9的结果，想要把所有能比对上的query ID和subject ID提取出来以后求这10个结果的交集，但是不会写代码干着急，求助帮忙～ 我要的是各自query ID和subject ID，然后求这十组数据的交集 blast －m [...]
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询问批量蛋白Blast
博主好！ 我有５００个蛋白序列想比较他们和小鼠，大鼠的同源性。 是不是就是把这５００个序列放到一个文件里面。序列之间如何分割，出来的结果的排序是什么样的？ 另外比较的参数如何设置。
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新手做BLAST时遇到的问题
博主你好！小弟不是第一次来这取经了，这次又遇上麻烦了，希望博主能赐教： 1.做blast的时候，小弟遇到了一个有“Matrix”的选项，里面有： PAM 30 PAM 70 BLOSUM 80 BLOSUM 62 [...]
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请教本地blast问题
我有一批序列要和nt数据库进行比对，现在下载了nt数据库，共9个文件：nt.00.tar.gz－nt.08.tar.gz，请问这些数据库下载后该怎样处理才能当作本地blast的数据库？
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教程：在NCBI批量Blast
先要多谢一下 Sophie 与 rebeccajiejie 的热心，让 云生物 看起来着实有些了活力。也希望更加的人参与进来回答问题。得开始认真宣传一下才行啊。 最近Sophie问了我关于批量Blast的问题。我尝试了一下NCBI的批量Blast，感觉非常不错。 写个教程分享一下。拿水稻的序列Blast做个例子。...
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如何大批量blast？
如何在windows7系统下进行大批量的blast。最好不要是linux系统的。之前曾经捯饬过这个系统，但是终究还是没有结果。 Ps，关于之前提到的“RM1~600是水稻的EST序列”，经过验证，我发现这句话不算正确，因为我在EST序列里面根本找不到序列，弹出来的只是GSS的相关信息。 我会再向提供信息的老师确认，并尽快将我认为正确的信息告诉大家。希望博主先把我之前的那条回复先删除了，免得引起别人的误会。文章题目是：武汉的温度持续上升到29度。 有劳博主。...
