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8万多条EST拼接？
手上拿到番茄果实的EST大概有8万多条，需要进行拼接，但是直接用cap3进行拼接的话，比较消耗时间，速度也慢。想请问各位大大，如何将这8万条序列进行cluster聚类，然后在小类里面可以cap3，最后把所有小类里面的结果进行cap3呢？ 能写个脚本最好了。。 拜托各位高手了...
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如何在bioperl调用 CAP3的模块用于EST聚类拼接
代码是我从CPAN中下载的，我不知道是不是这个！如何修改，请高手指点！ use Bio::Tools::Run::Cap3; # Run Cap3 using an input FASTA [...]
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cap3拼接结果中的singlets 按同样的条件可继续拼接。。
1，test.fa (>test1_fa >test2_fa >test3_fa >test4_fa >test5_fa >test6_fa >test7_fa ) cap3 [...]
