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批量序列如何进行Go和kegg的分析
现在手上有一批通过microRNA预测出来的靶标序列，想对它进行GO注释及富集还有kegg pathway的分析，但是现在不知道该怎么下手，也不知道该用什么样的软件，有没有高手给点建议的，最好是能够本地化的处理，总觉得通过网络不太稳定~~...
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关于如何查找蛋白质模块的功能
我做的是对一个蛋白质相互作用网络（Ecoli）进行聚类，得到了小模块，现在想查询其功能，看这模块找出来的效果咋样，一般是在MIPS和GO中查找，对吧！ 可是我的源数据是从DIP从下载的，蛋白质的名称全是类似DIP-2432N,DIP-563N这种类型的，而这种格式在MIPS和GO中不识别。。。。我的想法是在DIP数据库中通过查询结点，把DIP-2432N转化成MIPS中的结点，可好像现在这服务取消了啊。。现在我咋办，有没有哪个数据库直接识别上述名称的没。。。或还有其它的什么办法么？ 谢谢...
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NCBI的GeneID跟GO_term的一一对应
GO便是Gene Ontology。 前言请看：如何在NCBI实现大批量数据的一一对应 corelboy 的问题 帮他AD一下先：欢迎访问我的网站 http://www.bu-pathology.com ，我主要是做病理和医学图像分析的 想请教一下，这些大批量的数据在Linux下如何对应的具体操作步骤。比如我有一个list的geneID 我想跟GO [...]...
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怎样 go注释之柱状图
Sall4 Sall1 Zfp219 Arid3b Wdr5 Zfp462 Sox2 Mga Ubp1 Nac1 [...]
