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如何找出 cis-regulatory motif?
如果有一组微生物基因是 co-expressed (基于 microarray 数据), 要如何找出它们的cis-regulatory motif? 假设它们都是被同样一个 regulator 控制的。 [...]
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对FASTA格式的简单处理与统计的Perl程序
缘起 模仿lh3开发的网页版工具SeqTools 功能 1.格式化FASTA文件。 2.反向互补FASTA序列。 3.获取FASTA序列的长度。 4.计算GC含量并对ATGC计数。 5.搜索模式(子序列、motif等)。 改进 1.添加了GC含量的计算和ATGC的计数。 [...]
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关于MEME本地化求助
我现在想把MEME本地化预测Motif,在Ubuntu下安装时,到"make test"这一步就总是显示有一项错误,谁知道怎么解决?安装过MEME的给个建议,谢谢