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genomeworkbench里面的搜索序列如何保存
这个如何导成数据文本啊？
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如何下载模式生物的转录组数据
如何在ensembl或ncbi或者哪里下载一些模式生物（如人、斑马鱼）的转录组数据呢
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有关NCBI上下载数据库的问题
我现在要做本地 blast，现在要在NCBI上下载数据作为比对的数据库。在NCBI上搜索了自己想要的数据，因为量很大，结果有6000多条，不可能一条一条的选择，但是如果不选择直接下载就会出错误，下不了。有没有方法可以在NCBI上全选吖？我几乎看尽了所有的选项，似乎没有全选这个。。。NCBI上的FTP数据量太大了，下载下来有点不合适。。。...
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求助，关于在NCBI上下载数据库
我想在NCBI上下载某一个基因的全部序列，用来做本地blast的数据库，再跟自己的数据做比对。我试着用论坛里的方法，在NCBI中Search这个片段(植物的叶绿体片段)，但是找出来只有200多个。感觉这个结果有问题，平时自己在线blast时，一条序列都能比对出好几十条出来，何况还有那么多物种的呢！。。。我search的参数如下图，nucleotide,for plant cpDNA matK。请问，我的问题出在哪里吖？求帮助！ ...
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请教怎么在NCBI上画物种进化树~急~
请教怎么在NCBI上画物种进化树~急~ 谢谢啦~~
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GRCh37_chr1.fa 文件内注释文件的意义
NCBI下载的hs_ref_GRCh37_chr1.fa文件中存在下列信息，怎么解说这些注释的意思呢？谢谢大家; my email: guoshicheng2005@yeah.net >gi|224514618|ref|NT_077402.2| Homo sapiens chromosome 1 genomic [...]
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NCBI的GeneID跟GO_term的一一对应
GO便是Gene Ontology。 前言请看：如何在NCBI实现大批量数据的一一对应 corelboy 的问题 帮他AD一下先：欢迎访问我的网站 http://www.bu-pathology.com ，我主要是做病理和医学图像分析的 想请教一下，这些大批量的数据在Linux下如何对应的具体操作步骤。比如我有一个list的geneID 我想跟GO [...]...
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如何将fasta序列批量保存在本地txt.格式文件中
在NCBI获得的FASTA格式的序列，如果要保存到本地的txt.格式的文件中，是不是还需要自己手动一个一个的复制粘贴到文件中保存，有没有批量下载保存到txt.的方法？
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怎么在NCBI的nr database抽提同一种基因
由于需要对某种基因进行遗传分类（很大量），想从NCBI的nr里面提取这个基因，建立个dataset，然后用blast进行比对。如果直接用nr太大了，计算要花很多时间。望高手解答。
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问个弱问题,NCBI上怎么下个线粒体环？
柳城，问个弱问题，想在NCBI上下几个物种的线粒体的基因组，但不是下序列，想下个环图。包括些主要的基因示意，但是在Map viewer上都是详细信息，能下特别特别大概的环图么？PPT上用，多谢啦！！
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ncbi 的orf finder
dna序列能直接去orf finder么？ 我觉得这个问题好弱啊，但是我真的迷糊了。虽然有内含子序列，但是orf是基于起始密码和终止密码来的吧，那用dna得到的orf的部分应该和cdna去检测的结果差不多吧？
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教程：在NCBI批量Blast
先要多谢一下 Sophie 与 rebeccajiejie 的热心，让 云生物 看起来着实有些了活力。也希望更加的人参与进来回答问题。得开始认真宣传一下才行啊。 最近Sophie问了我关于批量Blast的问题。我尝试了一下NCBI的批量Blast，感觉非常不错。 写个教程分享一下。拿水稻的序列Blast做个例子。...
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ncbi的gene数据库
gene数据库里选定的基因怎么不能下载fasta格式的呢？ 比如说，我选定的20个基因，在display里面怎么没有fasta格式的呢？ 其他的格式貌似都 没有序列，how can i get the sequence? 不会只能一条一条点吧？
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关于“NCBI对于gene_info的建议”
之前曾经问过Liucheng有关如何将序列定位在染色体上的问题，得到回复之后，觉得应该将他提到的那个疑问贴出来一下，就算也让大家也知道一下NCBI确实是提过这个建议的，尽管我搞了半天愣是没有看懂。呵呵。欢迎大家鉴赏一下啊。也请大家帮忙解决以下我这个问题——如何将序列定位在染色体。不甚感激！ 以下是这个建议的website。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/help/genefaq.html 其中重要的部分我截过来。 Ps,注册这个网站之后，我咋觉得，我们都将是未来的网站元老呢，呵呵，鉴于这个自私的想法，所以就立马添了一篇文章。呵呵.........
