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如何做SNP在染色体的分布图
比如已经找出相关的SNP位点，然后想把这些SNP在染色体的位置画出来，有没有人知道怎么做？ 谢谢！
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一个处理序列的Perl脚本
源数据： 说明：1 >开头的为注释行，包含序列ID等信息 2 注释行下面两行是含有SNP的两个序列，末尾的数字是测序深度 3 *指示SNP的位置 目的：筛选测序深度均大于15，SNP为1的成组序列。输出格式为序列ID+序列信息。 Perl脚本： [...]
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SNPs数据的使用问题
由于本人不是生物出身，有些问题可能比较基础，望指教 SNPs好像只被用于人类，其他生物的SNPs数据没有重大意义，这个说法对吗？为什么？ 有没有其他生物的SNPs方面的研究呢？ GWAS的结果是找出一些SNPs (或其他变异), 它们作为一个指标，有较大可能性推导出疾病的发生, 但是GWAS之后是什么呢？ 如何验证这些结果？ 是在cell line上做实验吗? [...]...
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[专题]NGS（第二代测序）文献汇总
序： 下面是我认为比较重要的一部分文献，但个人所知有限，希望能够群策群力，继续补充完善，帮助别人、也帮助自己。 { }是分类，行首的[ ]表示软件名。 分类不是很清晰，有待完善。 {GENERAL} Zhang, J, [...]
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推荐：单核苷酸基因多态性（SNP）的研究
不定期的推荐资源。推荐牛人的博客。正所谓术业有专攻啊。欢迎大家有好的资源也一起推荐。 ============ 原标题：单核苷酸基因多态性（SNP）研究中的选点方法 原文链接：http://www.ifanqie.org/archives/324.html 博客作者：番茄芝 博客url：http://www.ifanqie.org/ ============ 单核苷酸基因多态性（SNP） 最近也开始接触这方面的东西，一切都在慢慢的学习，从选点开始，到酶切，tagman分型，到SPASS，SAS统计都是一个个的过程，为了学习+复习，分享一下学习到的选点的方法，进宫参考，高手勿笑。 1． [...]...
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请问如何统计SNP类型
我利用本地blast，将大量文库序列（实验室测序）与数据库比对，得到了比对结果，其中有大量SNP，请问如何统计不同类型SNP（转换、巅换等）数量。有没有相关软件？谢谢！
