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引物设计时简并碱基在3′端对PCR扩增的影响?

有时简并碱基出现在3′端的引物中,对PCR扩增影响如何? 还是同时设计两条引物(不用简并碱基)对扩增结果比较好?

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怎样 go注释之柱状图

Sall4 Sall1 Zfp219 Arid3b Wdr5 Zfp462 Sox2 Mga Ubp1 Nac1 [...]

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如何设计以慢病毒为载体的micoRNA反义寡核苷酸序列?公司给我设计的是什么

各位老师 如何设计以慢病毒为载体的micoRNA反义寡核苷酸序列?公司给我设计的是什么 意思? 我不明白设计反义寡核苷酸序列是否同设计正义序列一样需要PCR扩增前体(pre) 步骤??是扩增前体后设计的反义序列么、。?希望大家有空帮我分析下,万分感 激?谢谢了 以下是公司为我设计的目的基因片段 目的基因片段的获得: 引物合成 1.hsa-mir-xx-AgeI-F: [...]...

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如何让SOAPdenovo Kmers 大于31?

如题, SOAPdenovo文章上说的是k值最大可以到63,而软件默认值最大只是31,请问如何才能大于31啊?

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scan for matches软件:序列里的模式匹配

scan_for_matches Scan Nucleotide or Protein Sequences for Matching Patterns 不知有没理解错,这软件应该是通过正则来匹配核酸或蛋白序列的。 [...]

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增人气。

早上起来,继续刷屏。呵呵…… 其实,我很少留言的。呵呵……

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clustalW与PHYLIP的cmd调用命令

我最近在做生物信息学web系统。可实现序列联配,ORF查找,序列翻译,多序列对比,进化发育树构建,引物设计等功能。前面三个功能可实现。我使用的是PHP,现在想要调用clustalW和phylip。查遍网上资料,没有找到相关调用命令。特此来这个宝地请教下大侠!...

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新手求助

新手上路,,做毕业论文。想了解预测蛋白质二级结构的思路和步骤。有没有人能指导指导。万分感谢。

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求助统计显著性分析

我想分析在一组基因启动子中某一碱基组合出现次数是否是显著的,我又找了11组随机启动子背景序列和它对比,见图,请教怎么做统计学的显著性分析来找出哪个碱基组合在启动子中可以当做MOTIF?注:每组启动子都是160个,每组一共24万碱基,图中的数字表示在对应的一组启动子中出现该碱基组合的启动子个数...

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CD-HIT:批量去冗除和相似序列

继续分享资源。我没用过这软件。所以只是简单介绍一下。有用过的朋友可以详细讲讲用法。 CD-HIT 简介:CD-HIT stands for Cluster Database at High Identity [...]