有时简并碱基出现在3'端的引物中，对PCR扩增影响如何？ 还是同时设计两条引物（不用简并碱基）对扩增结果比较好？

SCWRL软件是用来预测蛋白质侧链构象的，目前最新版本是Dunbrack实验在09年开发出的SCWRL4。 跪求各位大侠，有没有会使用windows系统下的SCWRL4？目前我刚涉入这个课题，需要尽快掌握这个软件的操作，包括软件语言的写法，希望有人能帮帮我。 感激不尽...

氨基酸序列比对时，会出现“：”和“.”，这两个符号代表什么，是次保守和次次保守吗，如果是的话，次保守和次次保守具体指什么呢？谢谢

scan_for_matches Scan Nucleotide or Protein Sequences for Matching Patterns 不知有没理解错，这软件应该是通过正则来匹配核酸或蛋白序列的。 [...]

RT , THANK U ALL IN ADVANCE! 请问如何把同源基因ROMOVE 掉，找出NOVEL GENES...比如，运行了inparanoid.pl [...]

招聘职位如下： 生物信息员 工作地区：广州 招聘人数：1~3人 有效时间：至2011年6月份 职位职责： 数据分析和处理 应聘要求： 生物或计算机类相关专业本科(或以上)； 有生物学基础，了解基因组知识； [...]

我最近在仿真ISORANK算法（就是一种网络比法算法）。。应用的两个网络，分别是E.coli和H.pylori蛋白质网络，最后找到最大公共模块有113个结点，这找出来的是不是有点大啊。。。如何判断最后网络比对算法是不是好的呢。。。大家有什么建议。 我的做法是想判断最后找出的模块在数据库里的匹配率有多高，因为这个113个结点的模块结点数较多，下面就想到先聚类，把它分解成小模块，再查找，不知道这种方法有效不？。。。附这113个结点有1500多条边，可以说还是很紧密的。...

同源建模、分子动力学模拟和分子对接究竟是什么关系？同源建模了以后是进行分子动力学模拟对模型进行优化还是分子动力学模拟可以解决小分子和酶的动态的结合的过程？菜鸟求助，谢谢啦

大家好！请教大家usearch参数 - -iddef 2和 - -band 1是什么意思呢？谢谢！

主要问题由以下几个小问题构成： 1. 蛋白质疏水性的选取尺度根据什么考虑？我在http://www.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl中发现有好多疏水性的选项，要怎么选？还有它上面是单选的，可不可以一次计算多个（疏水性、蛋白）？ 2. 除了上面这个地方，还有其他的计算蛋白质疏水性的在线工具或软件吗？我想做的一个模型中原文是用的STRIDE，但是那个好像是关于蛋白质二级结构的一个东西； 3. 可不可以考虑用蛋白质的溶解度来计算其疏水性，因为我要考虑的溶剂就是水？那这样疏水尺度又有什么关系？ 小弟第一次提问，求解惑，不是专业人士，老师布置的翻译文献的作业，看着人家做的模型，疑惑特别大，想要动手改进一下。...

按照maqview的安装方法   1  "./autogen.sh; ./configure; make".  或者2.  "make -f Makefile.generic" to [...]

    最近需要预测昆虫的miRNA靶标，找到了miranda和TargetScan两款软件，不过这两款都是从同源性角度预测的，而且比较老，想问问有没有什么新的，比较好的软件，需要时本地版的，请高手指点，谢谢。

小弟我刚入门，用的是vector nti11.5版分析蛋白序列。完全不懂。请高手指点。 或者告诉我好的蛋白，主要看哪些方面的指标。 这个蛋白是用作克隆载体的。

Is there a database of all known phosphatases and their [...]